Chile desarrolla modelo genómico con 90% de precisión para mejorar variedades de ciruela japonesa

La SG combina información genética y modelos estadísticos para estimar el valor genético de características como fecha de floración, peso del fruto, contenido de azúcar o acidez, a partir de datos genómicos, sin esperar a que el árbol complete su ciclo productivo.

El profesor Pacheco detalla que “la selección genómica es una aproximación genético-estadística cuyo objetivo es aumentar la eficiencia en los programas de mejora genética. Consiste en la selección de individuos superiores en base a las características predichas en base al genoma de los individuos de las cruzas generadas. Dicho en palabras simples, la SG es como los servicios que en base a una muestra de DNA informan ancestría y predicen propensión a enfermedades y otras características en humanos, pero aplicado a plantas. La diferencia es que en un programa de mejora genética de plantas más del 98% de los individuos generados no es digno de ser seleccionado. Esto es un problema de costos para los programas de mejora, considerando que los árboles frutales se demoran entre 4 y 5 años entre que nacen y producen su primera fruta”.

“Al aplicar los modelos de predicción genómica de las plantas recién germinadas (luego de la extracción de DNA de todos los individuos de las familias generadas, secuenciación de esos DNA y predicción en los modelos en base a esas secuencias de DNA), el mejorador podría seleccionar a aquellas plántulas con un mayor potencial genético y concentrarse sólo en ellas en la crianza y fase de evaluación de campo. Con esto, la actividad de generación de nuevas variedades se hace más eficiente y con una chance de una mayor tasa de generación de variedades, en nuestro caso ‘made in Chile’, es decir, adaptadas a las condiciones de producción local”, añade.

En este trabajo se analizaron más de mil árboles, genotipificados con 11.000 marcadores moleculares (SNPs) y evaluados por dos temporadas. Los modelos alcanzaron capacidades predictivas entre 70% y 90% dependiendo de los rasgos, niveles que, según el investigador, “presenta una gran ventaja, ya que el tiempo y recursos invertidos en el desarrollo de estos individuos ahora serían dedicados a plantas que casi seguramente tendrán la calidad deseada”.

La implementación de esta tecnología permitiría crear variedades adaptadas al clima cambiante del país y con alto valor comercial, sin recurrir a transgénesis ni edición genética. “El impacto de este resultado es que en Chile tendremos la capacidad de generar nuevas variedades adaptadas a las condiciones ambientales de nuestro país, cada vez más cambiantes. Además, da la posibilidad de generar propiedad intelectual para variedades vegetales libres de modificación genética como transgénesis o edición genética, cuestionadas por parte de la población hasta el día de hoy”, destaca Pacheco.